【昊工具】RNA m6A甲基化修饰相关数据库，都是干货！

发稿时间：2020-12-15来源：天昊生物

RNA的m6A修饰研究，价格不菲，关键样品的损耗量也大。如何能在做实验前做点数据挖掘工作，少走点弯路呢？今天，小编为大家介绍几款RNA m6A甲基化研究常用（而且打得开）的数据库，请果断收藏！

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MTHFR基因有7个m6A修饰位点，每个位点的注释信息包括了基因组位置，基因位置，来源文章ID，检测技术，细胞系/组织，是否有对应SNP编号，是否处于RNA结合蛋白结合区，是否处于剪切区域，是否属于GWAS位点，是否存储于突变数据库等。

  b：甲基化水平（这里显示了所有样本的甲基化修饰水平，可以在红框内选样本类型，绿框内选择处理方法）

• 网址：http://rna.sysu.edu.cn/rmbase/

• 开发团队：中山大学生命科学学院屈良鹄教授团队

• 参考文献：RMBase v2.0: Deciphering the Map of RNA Modifications from Epitranscriptome Sequencing Data. Jia-Jia Xuan, Wen-Ju Sun, Ke-Ren Zhou, Shun Liu, Peng-Hui Lin, Ling-Ling Zheng, Liang-Hu Qu*, Jian-Hua Yang*.

• 数据库功能：RMBase v2.0整合了大量的表观转录组测序数据，探索RNA的转录后修饰，以及它们与microRNA结合、疾病相关SNPs和RNA结合蛋白（RBP）的关系。RMBase v2.0扩展了566个数据集，包括来自47项研究13个物种的1 397 244个修饰位点，比上一版本扩展了约10倍。它包含约1 373 000个N6-甲基腺苷(m6A)修饰位点信息、5 400个N1-甲基腺苷(m1A) 修饰位点信息、9 600个假尿苷(Ψ) 修饰位点信息、1 000个5-甲基胞嘧啶(m5C) 修饰位点信息、5 100个2′-O-甲基化(2′-O-Me)和约2 800个其他100种类型的修饰。

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