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【昊工具】A基因的DNA甲基化和B疾病到底相不相关?记得查查这2个数据库!

发稿时间:2021-02-26来源:天昊生物

1)肿瘤TCGA数据库数据(33种肿瘤类型的450K芯片数据,11种肿瘤类型的27K芯片数据)

2)NCBI GEO数据库数据(51种疾病类型的450K,27KRRBS测序数据)

3)其他类型数据 (来源于文献、其他数据的相关甲基化数据)

1)GeneSearch:查询基因名称或者基因组区域,获得这个基因或者区域在存在组间差异的疾病类型样本中的甲基化差异分析结果(均值,P值和图示)
如:搜索DEFB119基因结果展示存在组间甲基化差异的疾病类型列表:

点击具体疾病类型中的+Show按钮,可获得该基因所有探针在本疾病类型样本中的差异热图:

2)DiseaseSearch:直接选定疾病类型,搜索基因的甲基化差异分析结果

3)AdvanceSearch:直接选定疾病类型、甲基化检测平台,搜索基因的甲基化差异分析结果

4)更进阶的分析功能:可选择多个疾病,多个基因,除了常规的差异甲基化分析,还有生存分析,基因之间的相关性分析,疾病之间的相关性分析等

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