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公司公告

【昊文章】郑树森院士团队最新成果:GNA14高甲基化及其在HCC中的抑癌作用!

发稿时间:2021-04-02来源:天昊生物


一、数据分析发现GNA14作为HCC潜在甲基化相关的肿瘤抑制基因

为了获得HCC最重要的潜在肿瘤抑制基因,作者分析了TCGAGSE94660中的mRNA表达数据及TCGADNA甲基化数据。从TCGA甲基化数据中获得了535个差异甲基化基因(图1A),TCGA表达数据中获取了1088个在HCC肿瘤组织中显著下调的基因(图1B)。对三个数据集取交集发现了两个重叠的基因GNA14TBX15(图1C),GNA14表现出DNA甲基化水平上调(图1D),而mRNA表达下调(图1E),并且与HCC患者预后呈负相关,而TBX15并未显示出这一结果。因此,选定GNA14作为HCC的研究对象。



二、GNA14HCC中表达显著下调

为了确定GNA14HCC中的表达,利用qRT-PCR对收集的临床配对样本进行表达定量验证,结果发现GNA14 mRNA表达在肿瘤组织中显著下调(图2A-B)。此外,多株HCC细胞系表现出GNA14 mRNA表达水平更低(图2C)。多个配对样本和细胞系的GNA14蛋白水平同样显著更低(图2D-E)。ROC曲线分析GNA14在诊断TCGA数据库(AUC = 0.948)和本院HCCAUC = 0.935)中表现出较好的灵敏度和特异性(图2F)。免疫组化显示与匹配的正常组织相比,肿瘤组织中GNA14表达降低(图2G)。此外,GNA14的表达与临床特征相关,在本院HCC标本中,HBV感染组织(4.55倍)和血管侵袭组织(2.63倍)中GNA14 mRNA表达显著下调。在低分化组织(4.6倍)和复发患者组织(6.47倍)中,GNA14表达也显著降低(图2H