医学、农学新应用，天昊Accu16S细菌绝对定量测序技术在骨质疏松和农业复垦领域收获新文

发稿时间：2021-08-27来源：天昊生物

近期，天昊生物客户利用Accu16S^TM细菌绝对定量测序专利技术在揭示汉族老年人骨质疏松症相关肠道微生物群的变化，以及在腾格里沙漠土壤细菌群落对农业复垦的响应研究中取得最新进展。通过绝对定量检测，可以深入探讨样本微生物在绝对数量上的差异，相较常规的相对定量16S扩增子测序，结果更加全面，更加真实的反映样本微生物多样性及丰度情况。下面让我们简单看下这两篇文章。

1、英文题目：High-Throughput Absolute Quantification Sequencing Revealed Osteoporosis-Related Gut Microbiota Alterations in Han Chinese Elderly中文题目：高通量绝对定量测序揭示汉族老年人骨质疏松症相关肠道微生物的变化

期刊名：Front Cell Infect Microbiol.

影响因子：5.290

研究概要
越来越多的证据表明，肠道微生物在骨重建和骨健康维护中起着重要作用。本研究旨在探索肠道微生物与骨质疏松症风险的关系，并确定潜在的疾病相关分类群，这些可能有助于未来骨质疏松症预防和治疗。
本研究利用Accu16S^TM细菌绝对定量测序对44例骨质疏松症患者和64名对照者粪便细菌的绝对和相对丰度进行了检测，结合研究者之前对175个样本的相对丰度一同进行了分析。
研究发现，与对照组相比，骨质疏松症患者体内Bacteroidetes门、Bacteroides属和Eisenbergiella属的绝对和相对丰度较高。骨质疏松组Clostridium_XlVa、Coprococcus、Lactobacillus和Eggerthella属的绝对丰度增加，而Veillonella属的绝对丰度降低。在相对丰度方面，在骨质疏松组中，Parabacteroides属和Flavonifractor属的相对丰度增加，而Raoultella属的相对丰度减少。岭回归分析表明Bacteroides与腰椎骨密度和T评分降低有关，Anaerovorax与股骨颈骨密度增加有关。功能预测显示，骨质疏松症组中有10条KEGG途径得以富集。

图2、骨质疏松症组和对照组之间的功能差异预测。

可见，肠道微生物的组成可能会增加骨质疏松的风险。几个特定的菌群和功能途径被确定与骨密度降低有关。本研究为异常肠道微生物菌群在骨质疏松症发病中的潜在作用提供了流行病学证据。

2、英文题目：Response of soil bacterial community to agricultural reclamation in the Tengger desert, northwestern China

中文题目：腾格里沙漠土壤细菌群落对农业开垦的响应

期刊名： Applied Soil Ecology

影响因子：4.046

研究概要

在土壤水分稀缺、紫外线照射量大、温度波动大的条件下，沙漠中的植物生长极其有限。在过去的三十年里，在中国西北干旱地区，通过应用日光温室来开垦沙漠化土地用于农业已经得到发展。然而，由土地利用变化驱动的土壤微生物群的变化在很大程度上仍未被探索。

为此，本研究利用Accu16S^TM细菌绝对定量测序技术，检测了腾格里沙漠边缘葡萄园土壤细菌群落的多样性和组成。收集了两种类型的农业管理土壤，包括植物附近的土壤和施肥沟(FTL)上的土壤，以来自没有农业实践的开阔沙漠土地的土壤作为对照(CON)。

结果表明，农业复垦显著降低了荒漠土壤细菌多样性，同时促进了总细菌丰度从每ng DNA的10⁶个拷贝增加到约10⁸个拷贝，增加了90倍。在优势菌门分析中，发现Bacilli和Actinobacteria是对农业复垦特别是对施肥的养分输入作出反应的关键类群。微生物组的功能预测表明，氨基酸和碳水化合物的运输和代谢是三种土壤之间最重要的代谢途径。