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[文献汇总]与银屑病相关的微生物群落研究

发稿时间:2017-06-20来源:天昊生物

 

银屑病俗称牛皮癣,是一种常见的慢性复发性炎症皮肤病,根据皮损的特点,临床上银屑病分为四种类型,即寻常型、关节病型、红皮病型和脓疱型。近来来,越来越多的科学家开始研究银屑病相关微生物研究,今天,我们就盘点一下有关银屑病微生物群落的研究成果吧!

 

案例1   正常人和银屑病患者皮肤细菌菌群的比较

 

中文题目:正常人和银屑病患者皮肤细菌菌群的比较

英文题目: Comparison of bacterial microbiota in skin biopsies from normal and psoriatic skin发表杂志:Arch Dermatol Res

发表时间:2012    

研究对象:10名银屑病患者和12名健康对照组不对等部位的活检组织样本;

技术方法:细菌16S rDNA扩增子测序,V3-V4区;

研究平台:Roche 454-FLX GS-l00;

研究结果:

l  共鉴定到19个门和652个OTU。

l  在正常组和银屑病组最常见的三个门分别是厚壁菌门,变形菌门和放线菌门。

l  在正常组和银屑病组最常见的属是链球菌属。

l  在躯干的皮肤,与对照组相比,银屑病患者的变形菌门比例显著升高,与对照组相比,在银屑病患者中葡萄球菌和丙杆酸菌比例降低。


图3 所有样品门水平群落结构柱状图。C1–C13健康组,P14–P23银屑病组


案例2  银屑病患者皮肤菌群的分化

 

中文题目:银屑病患者皮肤菌群的分化

英文题目: Community differentiation of the cutaneous microbiota in psoriasis

发表杂志:Microbiome

发表时间:2013    

研究对象:银屑病患者皮损的皮肤(病变组),健康对照者位置相匹配的皮肤(对照组),银屑病患者身体对侧没有影响的皮肤(无影响组),共51个组;

技术方法:细菌16S rDNA扩增子测序,V1-V3区;

研究平台:Roche 454-FLX;

研究结果:

l  微生物多样性在对照组、无影响组、病变组依次减少。

l  与对照组相比,病变组和未受影响组群落丰富度和均匀度均降低。

l  PCoA分析显示病变组和其它两组的菌群结构截然不同。

l  与对照组相比,病变组在嗜铜雷氏菌属, 玫瑰弯菌属, 甲基杆菌属, 水生施莱格尔氏菌等四种菌属上丰度降低。

l  皮肤菌群可以分为两个不同的集群,称之为cutaneotypes:(1)变形菌门相关微生物;(2)厚壁菌门和放线菌门相关微生物,其中第2种类型菌在病变组比例相对于对照组较高。


图4 银屑病相关cutaneotypes证据


案例3  皮肤菌群受银屑病和特应性皮炎影响

 

中文题目:皮肤表皮菌群受银屑病和特应性皮炎影响

英文题目: Skin microbiota of first cousins affected by psoriasis and atopic dermatitis

发表杂志:Clin Mol Allergy

发表时间:2016    

研究对象:挑选了三个堂兄弟作为研究对象:一个受中度特异性皮炎影响,一个患银屑病,一个为健康对照组;使用刮匙在左耳后面2厘米区域采集两个皮损和两个非皮损区样本(银屑病和特应性皮炎),使用刮匙在左耳后面的2厘米区域采集样本(健康组);

技术方法:细菌16S rDNA扩增子测序;

研究平台:Ion torrent PGM平台;

研究结果:

l  银屑病组的厚壁菌丰度减少和变性菌门丰度增加。

l  与特异性皮炎组和健康组相比,银屑病组的链球菌科, 红杆菌科, 螺杆菌科,莫拉菌科丰度增加。

l  特异性皮炎组比银屑病组和健康受试者具有更大丰度的金黄色葡萄球菌。

l  此外,特异性皮炎组和银屑病患者的非皮损皮肤样本微生物组成与健康对照组的正常皮肤样本细菌组成非常相似。


图1 银屑病和特异性皮炎患者的皮损样本和健康组正常皮肤样本的门水平相对丰度


案例4  正常人和银屑病患者皮肤真菌菌群的比较

 

中文题目:银屑病患者皮肤真菌微生物分子鉴定

英文题目: Molecular characterization of the skin fungal microbiome in patients with psoriasis

发表杂志:J Dermatol

发表时间:2015    

研究对象:12例银屑病患者和12名健康对照者,使用镊子采集患者皮损样本,使用透明敷料采集正常人皮肤样本;

技术方法:26S rDNA扩增子测序,D1/D2区;

研究平台:Roche 454-FLX平台;

研究结果:

l  马拉色菌是两组最丰富的序列(银屑病46.9±14%,健康对照组76±14.6%)。

l  真菌微生物多样性在银屑病患者中显著增高。

l  PCA分析显示银屑病患者和健康对照者的真菌微生物组成有显著差异


图1.  真菌在各分类群中的分布。


案例5  银屑病患者水浴疗法前后皮肤微生物变化

 

中文题目:银屑病患者在理肤泉热保健中心使用水浴疗法前后皮肤微生物变化

英文题目:Skin Microbiome in Patients With Psoriasis Before and After Balneotherapy at the Thermal Care Center of La Roche-Posay

发表杂志:J Drugs Dermatol

发表时间:2015    

研究对象:54例诊断为中度至重度的寻常型银屑病患者,采集富硒水浴疗法治疗前和治疗3周后的患者样本,从受影响端和近端未受影响的皮肤采集拭子样本;

技术方法:16S rDNA扩增子测序;

研究结果:

l  在治疗前,银屑病患者受影响的皮肤样本和近端未受影响的皮肤样本具有相似的微生物多样性指数。

l  富硒水浴疗法治疗3周后,PASI值下降,意味着此水浴疗法降低了疾病的严重程度。

l  在治疗第三周结束时,银屑病患者从受影响端皮肤样本和近端未受影响皮肤样本菌群结构类似。

l  富硒水浴疗法在受影响和不受影响皮肤样本中增加了棒状杆菌和黄单胞杆菌丰度,这个菌在温泉和健康皮肤也被发现。

案例6  银屑病关节炎患者肠道菌群结构类似于炎性肠炎疾病患者

 

中文题目:银屑病关节炎患者肠道菌群结构与炎性肠炎疾病患者类似

英文题目:Decreased Bacterial Diversity Characterizes the Altered Gut Microbiota in Patients With Psoriatic Arthritis, Resembling Dysbiosis in Inflammatory Bowel Disease

发表杂志:Arthritis Rheumatol

发表时间:2015    

研究对象:17个银屑病关节炎患者(PsA),15个银屑病患者(PS),17个健康人(HLT)的粪便样品;

技术方法:16S rDNA扩增子测序,V1-V2区;

研究结果:

l  与健康组相比,银屑病关节炎患者和银屑病患者的肠道菌群结构差异较小; 

l  与健康组相比,银屑病关节炎患者及银屑病患者的肠道菌群丰度相对较低,例如银屑病关节炎患者和银屑病患者的粪球菌属比例都减少。在银屑病关节炎患者中疣微菌属、假丁酸弧菌属、瘤胃球菌属等菌属丰度显著降低,这说明银屑病关节炎患者有益菌的丰度较低;

l  银屑病关节炎患者肠道菌群结构与炎性肠炎患者类似,与银屑病患者和健康人菌群结构不同。银屑病关节炎患者肠道菌群结构与特定的炎症蛋白变化密切相关,例如在银屑病关节炎患者中血清分泌IgA水平上升和RANKL水平下降;

l  脂肪酸分析显示银屑病关节炎患者和银屑病患者含有较低水平己酸和庚酸;


图1.  银屑病关节炎患者,银屑病患者和健康人菌群结构差异。


关于天昊:

      天昊生物采用Miseq PE250测序策略对细菌16S rDNA区/真菌ITS区/真菌18S rDNA区的双V区或多种单V区进行测序,使用低循环数扩增,保证每个样品扩增的循环数统一;采用特殊方法可有效避免系统内误差;数据质量高,有效序列Q30达到80%以上;加上最新升级的分析内容和解释详尽的结题报告,带您享受极致的微生物扩增子测序体验。


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