天昊生物微生物多样性测序分析云平台操作指南

发稿时间：2018-10-11来源：天昊生物

天昊生物微生物多样性测序分析云平台操作指南

天昊生物微生物云平台GS-Online是由上海天昊生物构建，致力于为微生物多样性测序客户提供简单、快速的可视化分析，目前天昊生物微生物云平台GS-Online已覆盖微生物文章常用图表，共包含26项分析内容，客户可以根据根据自己的科研需求，自由分组，自由添加和修改。下面就给大家介绍一下云平台操作流程，真正做到生信分析求人不如求己。

使用指南

1 登录

打开浏览器，输入网址：http://cloud.geneskybiotech.com/ ，转到天昊生物微生物云平台GS-Online首页，在登录页面填写账户名和密码。

1、输入文件的位置

（1）OTU Table文件和Fasta Tre文件可以在数据结果的OTU文件夹中找到（如果您已经在我们公司做过相关项目并已获得项目数据的话）；env.xls文件和 sample.groups 文件一般在结果数据的最外层目录中。

2、OTU Table文件

（1）在OTU Table文件的第一行中，从第二列到“OTUsize”之前，表示的是样本名。

（2）OTU Table中的每一行的数据之间，以t（即制表符“Tab”）分隔。

（3）OTU Table中的样本名必须与sample.groups 文件中的样本名一一对应。

（4）OTU Table文件可以用Excel和文本文档打开。

（5）如果想重新分析，只是更改了分组，OTU Table文件不做任何处理。

（6）如果在OTU Table文件基础上需要删除某些样品，后面的sample.group文件也要删除对应样品。

（7）如果要删除某些OTUId，直接去除对应的行就可以。

（8）文件另存为文本可读的xls格式，不要另存为非文本可读的xlsx格式。

（9）最后另存为的文件能用文本文档打开且不乱码即可。

3、sample.groups 文件

（1）sample.groups 文件由2列组成，第一列是样本名（与OTU Table文件中的样本名一一对应），第二列是分组。如下图，第一列和上图OTU Table中的样本名相同，第二列分为A、B、C三组。1、2、3是A组，4、5、6是B组，7、8、9是C组。三组对比分析。

（2）sample.groups中的每一行的数据之间，以t（即制表符“Tab”）分隔。

（3）sample.groups文件可以用Excel和文本文档打开。

（4）如果想重新分组或重新命名组名，请打开OTU Table文件（subsample_otu.tax.0.03.xls文件），复制OTU表格中的样品名称，新建sheet表格，在sheet表格单元格A1中：点击右键-选择性粘贴-转置；在B列中输入对应的组名；点击另存为，保存为文本文件（制表符分隔）点击“确定”，点击“是”，最后另存为的文件能用文本文档打开且不乱码即可。

（5）如果想重新分组或重新命名组名，请打开OTU Table文件（subsample_otu.tax.0.03.xls文件），复制OTU表格中的样品名称，新建sheet表格，在sheet表格单元格A1中：点击右键-选择性粘贴-转置；在B列中输入对应的组名；点击另存为，保存为文本文件（制表符分隔）点击“确定”，点击“是”，最后另存为的文件能用文本文档打开且不乱码即可。